Laboratoire de biopuces
Grâce à son vaste programme de recherche, conjugué à un service exceptionnel, le Laboratoire de biopuces du CNRC offre au milieu universitaire et aux groupes de recherche internationaux, ainsi qu’aux entreprises privées au Canada, des biopuces à ADN de qualité supérieure. Il fabrique aussi des biopuces à protéines et fournit à ses clients de l’aide pour la conception d’expériences et l’analyse de données.
Le laboratoire se distingue au pays par la conjugaison de ses services, équipement et expertise. Créé en 1999, le laboratoire est le plus ancien à Montréal qui soit engagé dans la production de biopuces et le seul laboratoire au Canada autorisé à fabriquer et distribuer des puces pour la R-D en collaboration avec Génome Québec. Son équipe multidisciplinaire prête main-forte aux chercheurs qui participent à des projets du CNRC en génomique. Le laboratoire offre aussi la possibilité de prendre part à des projets avec droit de service (fee-for-service) ou à des collaborations de plus ample envergure.
Les membres du Laboratoire de biopuces et le groupe Génétique ont joué par ailleurs un rôle de premier plan dans l’assemblage et l’annotation du génome du pathogène fongique Candida albicans, et ont réussi à produire les premières biopuces non commerciales dont les chercheurs du monde entier se servent pour étudier C. albicans.
La technologie actuelle permet l’impression d’environ 50 000 éléments par biopuce. Une puce à ADN, ou biopuce, consiste en une lame de microscope traitée chimiquement pour permettre la fixation de l’ADN. Des molécules d’ADN y sont déposées en forme de matrices très régulières grâce à des instruments robotisés de haute précision. En raison du nombre accru des génomes entièrement séquencés, il est désormais possible de fabriquer des biopuces à ADN sur lesquelles tous les gènes d’un même organisme sont représentés.
L’équipe du Laboratoire de biopuces a développé de nombreuses applications, notamment :
- recherche sur le cancer et diagnostic (c’est-à-dire classification des tumeurs);
- recherche sur les maladies infectieuses;
- dépistage de la présence de la bactérie E. coli dans les aliments;
- sciences environnementales telles que la détection de pathogènes d’origine hydrique.
La technologie utilisée dans le programme de recherche de l’équipe scientifique du Laboratoire de biopuces du CNRC nous donne le précieux avantage de comprendre toute la complexité des expériences de biopuces et l’interprétation de leurs résultats.
Les services offerts :
- Conception et impression de biopuces sur mesure, à la surface desquelles peuvent être appliqués des oligonucléotides ou des fragments d’ADN; services de conseils dans la conception des biopuces;
- Production de biopuces à protéines (contenant des anticorps, des protéines purifiées ou des extraits biologiques);
- Service d’hybridation et de lecture de biopuces, et analyse de données;
- Conseils pour la conception d’expériences;
- Programmes de formation adaptés à la fabrication des biopuces, le marquage des ADNc, les hybridations, la lecture et l’acquisition de données;
- Support bioinformatique et accès aux banques de données de profils d’expression;
- Production et contrôle de qualité des amplicons PCR.
Services complémentaires
- Amplification et purification des réactions PCR à haut rendement;
- Transferts robotisés de 96 puits à 384 puits à des fins de dilution ou de propagation de librairies;
- Accès à la banque de données BRIDNA, une application Web, gratuite, qui permet la gestion d’échantillons représentés sur les biopuces.
Notre expertise
- Fabrication de biopuces à ADN et à protéines destinés à la R-D;
- Conception d’expériences;
- Analyse de données.
L’équipement
Notre équipement dernier cri comprend :
- trois imprimantes de biopuces à ADN équipées d’une tête imprimante de 48 épingles utilisant la technologie d’épingle « quill »;
- deux lecteurs confocaux à fluorescence ScanArray Lite pour l’analyse des biopuces;
- un poste de travail automatisé muni du robot Biomek FX pour la manipulation des liquides;
- deux chambres d’hybridation;
- un bioanalyseur Agilent 2100 pour la vérification.
Personne-ressource
Eileen Raymond
Téléphone : 514-496-6349
Courriel : Eileen.Raymond@nrc-cnrc.gc.ca
- Date de modification :
